2011年6月13日，历经起草、多次研讨和修订，中海通研究院章程和基本管理制度通过审议，包括《中海通研究院章程》、《中海通研究院学术委员会工作规则》、《中海通研究院经费管理办法》、《中海通研究院课题管理办法》、《中海通研究院成果管理办法》、《中海通研究院研究员管理办法》、《中海通研究院顾问聘请管理办法》，这些规章制度构成研究院管理及运行的基本准则。